序列編輯：

允許用戶直接對序列進行編輯，包括插入、刪除、替換等操作。

支持多序列文件的打開和編輯，便于同時處理多個序列。

提供撤銷和重做功能，確保編輯過程中的每一步都可以被恢復或撤銷。

序列比對：

支持手動和自動序列比對，幫助用戶發現序列之間的相似性和差異性。

提供多種比對算法和參數設置，以滿足不同研究需求。

比對結果可以直觀地顯示在編輯窗口中，便于用戶進行分析和注釋。

系統發育分析：

提供了基本的系統發育樹查看器，允許用戶查看和編輯基于序列相似性的進化樹。

雖然BioEdit可能不是進行復雜系統發育分析的首選工具，但它可以作為一個起點或輔助工具來使用。

格式支持和數據導入導出：

支持多種序列文件格式，如GenBank、FASTA、PHYLIP等，方便用戶與不同軟件和數據庫進行交互。

允許用戶從剪貼板直接導入數據，無需先保存到文件中。

支持將編輯后的序列導出為多種格式，便于與其他研究人員或軟件共享數據。